庄闲和app 单细胞umap图绘制教程|也许是全网最好看的
2026-01-14图片 作者按 大家或许都曾被Nature, Science上的单细胞umap图吸引过,不免心生崇拜。在这里,我们将介绍一种简单方便的顶刊级umap图可视化 全文字数|预计阅读时间: 2000|5min {jz:field.toptypename/} ——Starlitnightly(星夜) 环境加载 我们先导入一些必须的依赖包 importomicverseasovimportscanpyasscimportmatplotlib.pyplotaspltov.ov_plot_set() ____
庄闲和游戏网 plot1cell美化UMAP/TSNE结果
2026-01-14plot1cell简介 plot1cell——高级单细胞数据可视化包,可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图,主要依赖于Seurat,circlize,ComplexHeatmap等R包 图片 调用的函数分别存放在R文件夹里面 图片 里面是分别是画不同图用到的脚本,可以帮助我们理解绘图用到的函数,也方便有需要是进行一些参数的修改! 根据帮助文档介绍来看,plot1cell可以基于seurat结果进行可视化: 细胞聚类分群的圆圈图各组基因表达点图跨组别基因表达的小提琴图跨组的 Uma




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