庄闲和 【LlamaIndex教程】1. 数据连接模块教程（附代码）
2026-01-14大家好，我是同学小张，持续学习C++进阶知识和AI大模型应用实战案例，持续分享，欢迎大家点赞+关注，共同学习和进步。 上篇文章我们通过一个简单的例子，学习了LlamaIndex的安装和基本使用，使用 LlamaIndex 构建了一个简单的RAG问答系统。今天我们开始系统化学习，首先看一下LlamaIndex的Load部分。Load部分负责文件数据链接。 0. 文件类型加载器：SimpleDirectoryReader 上篇文章代码的一开始，我们就使用了这个Reader： fromllama_i
庄闲和 胃癌单细胞数据集GSE163558复现(五)：细胞比例
2026-01-14图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第五期。第四期，我们使用了DimPlot、FeaturePlot、DoHeatmap、DotPlot等多种函数对细胞群和基因进行了可视化。本期，我们将绘制饼图、堆积柱状图、箱线图、气泡图等，比较不同分组之间细胞比例差异。 1.背景 在细胞分群命名完成之后，我们可以比较不同样本和分组之间细胞比例的差异。细胞发生癌变、肿瘤细胞转移、药物治疗等刺激因素，都会导致肿瘤微环境中细
图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第六期。第五期我们通过绘制饼图、堆积柱状图、气泡图等，比较不同分组之间细胞比例差异。本期，我们将下载胃癌bulk数据（TCGA-STAD），筛选胃癌相关差异表达基因，根据差异基因list，使用AddModuleScore_UCell函数给上皮细胞亚群Seurat对象添加恶性评分，以此协助区分正常上皮和恶性上皮。 1.背景介绍 众所周知，胃癌细胞是胃上皮细胞发生了恶性病变
庄闲和游戏 胃癌单细胞数据集GSE163558复现(七)：评估恶性上皮细胞增殖及迁移能力
2026-01-14图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第七期。第六期我们根据TCGA数据库中胃癌和正常胃组织之间的差异表达基因，定义了每个上皮细胞的恶性和非恶性评分。本期，我们将分析恶性上皮细胞G0-G4的Marker基因并绘制热图和小提琴图，此外，我们还将使用AddModuleScore_UCell函数计算细胞的增殖和迁移评分。 建站客服QQ：88888888 1.背景介绍 细胞增殖是生物体的重要生命特征，细胞以分裂的方
庄闲和游戏网 胃癌单细胞数据集GSE163558复现(八)：拟时序分析
2026-01-14图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第八期。第七期我们使用AddModuleScore_UCell函数计算细胞的增殖和迁移评分。本期，我们将使用monocle2进行拟时序分析。 1.背景介绍 系列推文前七期，我们共同学习了单细胞测序的基础分析，从第八期开始，我们将陆续学习拟时序分析（Pseudo-Temporal Analysis），“Copykat”分析及细胞通讯等高级分析。 疾病是一个动态变化的过程，
庄闲和 大数据监控了你的手机，教你关闭手机监听开关，摆脱监控
2026-01-14今天给大家分享一下如何关闭监控的广告开关，摆脱大数据监控您的手机！大家有没有感觉我们的手机好像对我们非常了解，仿佛成了最懂我们的那个人，我们每次你刚刚和别人聊完什么，然后手机呢就会给你推送什么，或者说我们刚在某个软件上买完东西，别的软件也会给你推送类似的产品，其实这就是现在的大数据互联网，那么我们怎样才能避免被跟踪，怎样才能保护我们的隐私呢？下面我们就一起来关闭监控的开关吧！ 首先第一步，我们需要去手机的设置里面，把有关于广告的那些开关按钮把它关闭。我们点开设置之后呢，直接点击上方这里的搜索框
庄闲和 胃癌单细胞数据集GSE163558复现(十)：CopyKAT分析
2026-01-14图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第十期。第九期我们用TCGA-STAD数据进行生存分析。本期，我们将回到高级分析（CopyKAT分析），通过计算CNV评估上皮细胞良恶性。 1.背景介绍 在第六期推文中，我们联合TCGA-STAD数据给上皮添加了恶性评分，从而协助区分肿瘤细胞与非肿瘤细胞。在高级分析中，我们可以利用inferCNV和CopyKAT对单细胞进行CNV(Copy number variati
庄闲和游戏网 胃癌单细胞数据集GSE163558复现(十一)：T细胞亚群细分
2026-01-14{jz:field.toptypename/} 图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第十一期。第十期我们使用通过CopyKAT分析计算CNV评估上皮细胞良恶性。本期，我们将对T细胞亚群进行细分。 1.背景介绍 德国哲学家莱布尼茨说过:“世上没有两片完全相同的树叶。”物种是有其多样性的。对于细胞来说同样如此。从理论上讲，我们可以对细胞亚群进行无限分群。在初次分群时，可以不断调整分辨率，同样在细胞注释之后，我
庄闲和游戏 胃癌单细胞数据集GSE163558复现(十二)：细胞通讯
2026-01-14图片 前言 Hello小伙伴们大家好，我是生信技能树的小学徒”我才不吃蛋黄“。今天是胃癌单细胞数据集GSE163558复现系列第十二期。第十一期使用singleR对T细胞亚群进行细分。本期，我们将进入胃癌复现的最后一章，“细胞通讯”。 1.背景介绍 肿瘤微环境中细胞类型、数量以及功能一直处于动态变化的过程，各类型的细胞组成了一个有序的统一体，而细胞之间频繁的“互动”维持着统一体的动态平衡。这种互动不仅存在于同类型细胞之间，存在与不同类型的细胞间，甚至是单个细胞的不同时间维度上。我们把这种互动，
备案号: