庄闲和 如何计算LD衰减一半的距离?
2026-01-14大家好,我是邓飞。 LD衰减图,可以形象的查看群体LD衰减的情况。LD衰减是由于连锁不平衡所致,LD衰减速度在不同物种或者不同亚种中差异不同,通常用LD衰减到一般的距离来作为群体的衰减距离(还有其它计算方法),如果LD衰减很快,则在进行GWAS分析时需要更多的位点才能达到一定的精度。(计算群体GWAS分析所需要的最少SNP个数) 另外,LD衰减也可以反应群体受选择的情况,一般来说,野生群体比驯化改良群体LD衰减快,异花授粉比自花授粉植物LD衰减快。 之前写过推文教程(LD衰减图绘制--PopL




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